Les pirates du Général Hunter assiègent le repaire d'Albator pour s'emparer de son butin. L'enjeu est de taille car c'est ici même que Toshiro, dans son labo souterrain, prépare l'Atlantis, le futur vaisseau d'Albator. Le capitaine corsaire et son équipe pourront-ils sauver ce refuge de la destruction ?