En 1973, le monstre Gamera se sacrifie en sauvant la vie d'un jeune garçon attaqué par une horde de dangereux Gyaos. Trente ans plus tard, le fils de ce garçon découvre un oeuf qui, après éclosion, révèle un nouveau Gamera. Tous deux deviennent de fidèles amis et le petit monstre grandit rapidement. Le jeune Gamera découvre peu à peu ses pouvoirs, mais un nouveau monstre menaçant appelé Zedus fait son apparition. Gamera pourra t'il s'opposer à lui ?