Berlin, 1942. Un scientifique, officier SS, réalise que ses travaux sont utilisés pour organiser rationnellement l'extermination des Juifs déportés dans les camps de concentration. Il décide d'alerter le Pape. A Rome, il fait la connaissance d'un jeune jésuite, Ricardo Fontana, qui lui apporte son aide.
Un film indispensable et salutaire, qui restitue toute l'horreur de l'entreprise scientifique d'extermination des juifs par les nazis pendant la Seconde Guerre mondiale, et qui aborde de front le comportement des autorités catholiques face au génocide. Le metteur en scène Costa Gavras (Le Couperet, Z, L'Aveu), qui depuis toujours n'a de cesse de dénoncer la lâcheté, la violence d'état, le totalitarisme et l'extrémisme. Avec Amen, il use d'une réalisation sobre et puissante, servie par les interprétations exceptionnelles de Ulrich Tukur et de Mathieu Kassovitz, pour relater le parcours authentique de cet officier SS prenant conscience de l'horreur de la Solution Finale et qui va tout tenter pour rendre public l'indicible.