Dix ans après l'arrivée du premier Torus, deux autres monolithes font leur apparition sur Terre. Le premier Torus avait profondément bouleversé la hiérarchie mondiale, tant sur le plan politique que religieux. Le docteur Mason Rand le sait mieux que quiconque : il est poursuivi par les adeptes de la toute-puissante secte baptisée «Coalition Genesis». Celle ci cherche à l'éliminer afin de l'empêcher de révéler la vérité sur ces monolithes. Au péril de sa vie et de celle de son fils, Rand va devoir mettre à l'épreuve ces monolithes, qui peuvent entraîner la destruction de la planète, mais qui représentent également un réel espoir de sortir du chaos...