Carmen et Juni adorent l'histoire que leur raconte leur maman le soir avant qu'ils ne s'endorment, celle de l'espion et de l'espionne qui tombent amoureux l'un de l'autre alors qu'ils avaient pour mission de s'éliminer. Ce que les deux petits ignorent, c'est que l'histoire n'a rien d'imaginaire et que leurs parents, Ingrid et Gregorio, étaient ces supers agents secrets. Lorsque leurs parents partent pour une ultime mission et que la maison familiale est attaquée, les deux enfants découvrent la vérité. Menacés, ils prennent les choses en main. A la recherche de leurs parents retenus captifs, les voilà propulsés dans un univers d'espionnage délirant et fantastique.

Avec Spy Kids, le réalisateur Robert Rodriguez signe une parodie de film d'espionnages totalement délirante pour un long métrage résolument destiné aux plus jeunes. Les enfants s'identifieront en effet facilement à ces espions en herbe et à leurs aventures exotiques, dignes de l'inspecteur Gadget et de James Bond réunis. Armé d'une avalanche de gadgets plus sophistiqués les uns que les autres, Spy Kids ne recule devant rien, et bénéficie en plus de l'interprétation impeccable des comédiens Antonio Banderas, Carla Gugino et Danny Trejo dans un divertissement spectaculaire totalement assumé.